液滴式测序文库构建系统

型号:10xGenomicsChromium

 
型号:10xGenomicsChromium
地点:北京大学吕志和楼401
仪器技术参数:
应用微流体芯片将样品(单细胞)快速进行分区,而后添加序列标签,对样品进行定相结构变异分析、单核苷酸变异及插入分析,以及对数万个单细胞进行动态基因表达谱分析。
1.处理样本类型:一种微流体芯片兼容不同大小及不同类型的真核细胞(贴壁细胞、悬浮细胞、组织、血液等);
2.简单的实验操作流程:仪器每次运行时间为7分钟,实现快速裂解细胞对基因表达影响最小,精确地获得转录组数据;
3.样本处理通量:仪器可同时运行1-8个通道,每次运行最多可产生48,000个单细胞的转录本;
4.分区与标签数:每次运行产生>8万个纳升级分区,含有75万个独特的序列标签(每个标签由14个碱基构成);
5.细胞捕获效率:在样本细胞群体中捕获大于50%的细胞,每1000个细胞中含有双细胞的比例低于0.9%;
6.文库测序仪兼容性:系统提供Illumina兼容测序文库,建库样本满足illumina测序仪要求;
7.应用类型:可提供3’基因表达谱文库,5’基因表达谱文库,T细胞受体和B细胞受体VDJ区域全长测序文库
 
仪器功能特点:
系统可以完成长片段基因组测序文库构建和单细胞表达测序文库构建。在长片段基因组测序文库构建领域,通过为长片段添加标签而实现在短测序读长的情况下获得长片段的信息,系统可以用于基因组denovo组装,基因组单倍型分析,基因组结构变异分析,phasingSNP分析等。在单细胞测序领域,该系统可一次检测80000个单细胞的cDNA同步建库,然后在illumina测序平台上完成细胞的基因测序,获得每个细胞的主要基因的表达情况信息,研究样本中的细胞种群分布。目前该系统主要应用于:肿瘤组织中细胞的异质性,区分肿瘤组织中的每个细胞的类型和分布比例;免疫学,研究人在不同疾病状态下免疫细胞的分布;干细胞生物学,研究细胞的分化和进化等。